A partir del 24 de octubre comienza la segunda edición de la Copa Argentina, con algunos cambios con respecto a la anterior.
La misma contará con la participación de 224 equipos de diferentes categorías del fútbol local y estará dividida en una Fase Preliminar, una Inicial y una Final. El máximo premio para el campeón será la clasificación directa a la Copa Libertadores 2014. Todos los partidos se disputarán por el sistema de eliminación directa, a un solo partido, en estadio a designar por la AFA y/o el Consejo Federal, según corresponda.
Fase preliminar. El sistema de clasificación a la Copa comienza en la Fase Preliminar, en donde 100 equipos del Torneo Argentino “B” se enfrentarán y de donde clasificarán 50 a la Fase Inicial.
Fase inicial. En esta fase habrá 5 eliminatorias. En la 1ra participan los 18 equipos de la Primera “D” más 8 equipos de la Primera “C” (incluyendo al ascendido y los 7 de menor cantidad de puntos en la Tabla Final de Posiciones del Campeonato de Primera “C” 2011/2012, (excluyendo al descendido) de donde clasifican finalmente 13 equipos.
En la 2da eliminatoria participarán los 21 grupos de la Primera “B”, los 12 equipos restantes de la Primera “C” más los 13 clasificados de la 1ra eliminatoria, de donde clasificarán 23 . En la 3ra eliminatoria actuarán los 50 equipos pre-clasificados del Torneo Argentino “B” (según lo disponga el Consejo Federal), de donde clasificarán 25 .La 4ta eliminatoria será el turno de los 25 equipos del Torneo Argentino “A” más los 25 clasificados de la 3ra eliminatoria, de donde clasificarán 25 equipos. En la 5ta eliminatoria quedarán 24 equipos del resultado de los 23 equipos clasificados de la 2da con los 25 clasificados de la 4ta
Fase final. Participarán los 20 equipos de la Primera División más los 20 de la Primera “B” Nacional más los 24 clasificados de la 5ta eliminatoria de la Fase Inicial. En esta fase habrá una etapa preliminar y una eliminatoria.